Nová podoba expozice, nacházející se v barokní kapli Nanebevzetí Panny Marie, prezentuje církevní oltářní architekturu a sochařství z období renesance a baroka. Nejvýznamnějšími vystavenými památkami jsou renesanční epitafy rodiny Thunklovy z roku 1579 a rodiny Pirchanovy z roku 1597, oltář sv. Ignáce z Loyoly, vytvořený v roce 1625, a oltář sv. Anny z roku 1683. Celek je doplněn dvěma ukázkami kvalitních, raně barokních epitafů z kostela Nejsvětější Trojice. Část expozice tvoří ukázky barokního sakrálního sochařství pocházejícího převážně z Jindřichohradecka.